1 ယူနစ် (U) Taq Platinum DNA Polymerase လုပ်ဆောင်ချက်ကိုမိနစ် ၃၀ အတွင်း ၇၄ ဒီဂရီစင်တီဂရိတ်တွင်အက်ဆစ်မပျော် ၀ င်နိုင်သောအရာများထဲသို့ ၇၀ ဒီဂရီစင်တီဂရိတ်တွင်ထည့်သွင်းရန်လိုအပ်သောအင်ဇိုင်းပမာဏအဖြစ်သတ်မှတ်သည်။
SDS-PAGE ထောက်လှမ်းခြင်းဖြင့်သန့်ရှင်းစင်ကြယ်မှုသည် ၉၉%၊ exogenous nuclease ၏လုပ်ဆောင်မှုကိုမတွေ့ပါ။ လူသား၏မျိုးရိုးဗီဇတွင်မိတ္တူဗီဇကိုထိရောက်စွာချဲ့ထွင်နိုင်သည်။ တစ်ပတ်အပူချိန်အခန်းအပူချိန်တွင်သိုလှောင်ထားလျှင်သိသာထင်ရှားသည့်လုပ်ဆောင်ချက်မရှိပါ။
၎င်းတွင် 5′-3 ′exonuclease လုပ်ဆောင်ချက်နှင့် 3′-5′ exonuclease လုပ်ဆောင်ချက်ပါရှိပြီး၎င်း၏တည်ကြည်မှုသည် Pfu polymerase ဘေးတွင်ရှိသည်။ Taq Platinum Polymerase ၏ extension speed သည် Pfu polymerase ထက်ပိုမြန်ပြီး amplification efficiency လည်းပိုမြင့်သည်။ PCR ထုတ်ကုန်များသည်တုံးသောအဆုံးသို့ TA vector ဖြင့်ပုံတူပွားနိုင်သည်။ အကယ်၍ cloning efficiency ကိုတိုးတက်ကောင်းမွန်စေလိုလျှင် TA vector သို့ cloning မလုပ်မီပထမဆုံးသန့်စင်ရန်နှင့် 3'-dA overhangs များကိုထည့်ရန်အကြံပြုသည်။
One-tube Taq Platinum MasterMix (အမျိုးသားအဆင့်မြင့်နည်းပညာထုတ်ကုန်အသိအမှတ်ပြုလက်မှတ်)
Ta The Taq Platinum MasterMix သည် PCR တုံ့ပြန်မှု၏တိကျမှုနှင့်အာရုံခံစားနိုင်စွမ်းကိုတိုးတက်ကောင်းမွန်စေပြီးမြင့်မားသော GC အကြောင်းအရာ၊ ဆင့်ပွားတည်ဆောက်ပုံနှင့်တူသောရှုပ်ထွေးသောတင်းပလိတ်များကိုချဲ့ထွင်နိုင်သည်။ ပစ်မှတ်တမ်းပလိတ်ကိုမိတ္တူ ၂ စောင်လောက်အထိချဲ့နိုင်ပြီးပိုမိုတိကျသောစမ်းသပ်မှုရလဒ်များကိုသေချာစေနိုင်သည်။
unique ထူးခြားသော Taq Platinum MasterMix ဖော်မြူလာသည်တုံ့ပြန်မှုစနစ်တစ်ခုလုံးကိုအလွန်တည်ငြိမ်စေပြီး ၄ ဒီဂရီစင်တီဂရိတ်တွင်ထပ်ခါထပ်ခါအေးခဲခြင်း (သို့) ရေရှည်သိုလှောင်မှုကြောင့်လှုပ်ရှားမှုကိုထိခိုက်လိမ့်မည်မဟုတ်ပါ။
stable တည်ငြိမ်ပြီးအကျိုးရှိစွာကြိုတင်ပြင်ဆင်ထားသော PCR ရောစပ်ထားသောအဖြေသည်စစ်ဆင်ရေးကိုလျင်မြန်ပြီးရိုးရှင်းစေနိုင်ပြီးအလုပ်သမားပြင်းထန်မှုနှင့်နမူနာယူပုံအမှားကိုများစွာလျှော့ချပေးနိုင်သည်။ PCR အခြေအနေများအတွက်လိုအပ်ချက်များကိုလျှော့ချပေးသောစွမ်းဆောင်ရည်မြင့် PCR ကိုမြှင့်တင်ခြင်းနှင့်ပိုကောင်းစေခြင်းကိုလည်းပေါင်းစပ်ထားသည်။
■ဤထုတ်ကုန်တွင်ဆိုးဆေးပါ ၀ င်ခြင်းနှင့်ဆိုးဆေးကင်းစင်သည့်စနစ်နှစ်မျိုးရှိသည်။ ဆိုးဆေးပါ ၀ င်သော MasterMix ထုတ်ကုန်များကို loading buffer မထည့်ဘဲ PCR ပြီးနောက်တိုက်ရိုက်လျှပ်ကူးနိုင်ပါသည်။
၎င်းသည် genomes ကဲ့သို့ရှုပ်ထွေးသောတင်းပလိတ်များမှမြင့်မားတည်ကြည်သောထုတ်ကုန်များကိုချဲ့ထွင်ရန် Pfu polymerase ကိုအစားထိုးနိုင်သည်၊ ၎င်းသည်စကားအသုံးအနှုန်းဗီဇများပုံတူပွားခြင်း၊ site-specific mutations နှင့် single nucleotide polymorphism (SNP) စသည်တို့ကိုအသုံးချရန်သင့်တော်သည်။
PCR Primers များဒီဇိုင်းရေးဆွဲရာတွင်သတိထားရမည့်အချက်များ
primer အရှည်သည်အများအားဖြင့် 20-25 mer ဖြစ်သည်။ သို့သော်ရှည်လျားသောအပိုင်းအစ PCR ကိုလုပ်ဆောင်သည့်အခါ primer အရှည်ကို ၃၀ မှ ၃၅ အထိတိုးမြှင့်သင့်သည်။
prim primer နှစ်ခုကြားအထူးသဖြင့် 3 ′အဆုံး၌နောက်ဆုံးအခြေခံ ၃ ခုအတွက်တွဲစပ်ထားခြင်းမရှိချေ။
■ GC ပါဝင်မှု ၅၀-၆၀%ရှိသင့်ပြီးဒေသခံကြွယ်ဝသော GC သို့မဟုတ် AT ကိုရှောင်ပါ။ primer နှင့် template ကိုတည်ငြိမ်စွာချည်နှောင်နိုင်ရန်အတွက် 3 ′end တွင် AT rich structure ကိုရှောင်ပါ။
secondary Secondary ဖွဲ့စည်းရန် primer ကိုရှောင်ပါ။
m Tm အပူချိန်တစ်ခုနှင့်တစ်ခုနီးကပ်သော primer နှစ်ခုကိုရွေးပါ။
PCR အတွက် primers ၏ Tm တန်ဖိုးတွက်ချက်ခြင်း
the primer သည် 20 mer ထက်နည်းသောအခါ Tm = 2 ° C × (A+T)+4 ° C × (G+C)
er primer သည် 20 mer ထက်ပိုသောအခါ Tm = 81.5+0.41 × (GC%)-600/L, L သည် primer ၏အရှည်ဖြစ်သည်။
an မီးဖိုအပူချိန် (Tm-5) ° C တွင်ထားပါ။
primers ၏သင့်တော်သောနောက်ဆုံးအာရုံစူးစိုက်မှုကို 0.1 μMနှင့် 1.0 μMကြားတွင်ရွေးချယ်နိုင်သည်။ primer အာရုံစူးစိုက်မှုနိမ့်လွန်းခြင်းကြောင့်အသံချဲ့စက်များ၏အထွက်နှုန်းနိမ့်ကျစေပြီး primer အာရုံစူးစိုက်မှုမြင့်လွန်းပါကတိကျသောအသံချဲ့စက်ကိုပိုမိုဖြစ်ပေါ်နိုင်သည်။ ပုံမှန်အားဖြင့်၊ ပုံစံ DNA ၏ DNA ပမာဏကို (သို့) ရှုပ်ထွေးသောပုံစံခွက် DNA (လူသားမျိုးရိုးဗီဇ DNA ကဲ့သို့) ကိုပုံစံခွက်အဖြစ်သုံးသောအခါ primer စုစည်းမှုသည်နိမ့်သင့်သည်။ ပုံစံခွက် DNA ပမာဏကိုသေးငယ်။ ရိုးရှင်းသောပုံစံခွက် DNA (ဥပမာ plasmid DNA စသည်) ကို template တစ်ခုအဖြစ်သုံးသောအခါ primer concentration ပိုမိုမြင့်မားသင့်သည်။
ထုတ်ကုန်အားလုံးသည် ODM/OEM အတွက်စိတ်ကြိုက်ပြုလုပ်နိုင်ပါသည်။ အသေးစိတ်အတွက်၊ကျေးဇူးပြုပြီး Customized Service (ODM/OEM) ကိုနှိပ်ပါ။
1 kb အပိုင်းအစကိုချဲ့ရန် genomic DNA ကိုပုံစံခွက်အဖြစ်သုံးပါ။ PCR တုံ့ပြန်မှုပြီးနောက် electrophoresis ထောက်လှမ်းမှုအတွက် 5 μlယူပါ။ |
A-1 Template
template ပုံစံတွင်ပရိုတင်းအညစ်အကြေးများ (သို့) Taq inhibitors များပါ ၀ င်သည်။
template ပုံစံခွက်၏ denaturation သည်မပြည့်စုံပါ - denaturation temperature ကိုသင့်လျော်စွာတိုးမြှင့်ပေးပြီး denaturation အချိန်ကိုရှည်စေသည်။
■ပုံစံခွက်ပျက်စီးခြင်း —— ပုံစံခွက်ကိုပြန်လည်ပြင်ဆင်ပါ။
A-2 Primer ပါ
ers primer များ၏အရည်အသွေးညံ့ဖျင်းခြင်း-primer ကိုပြန်လည်ပေါင်းစပ်ခြင်း
er Primer ပျက်စီးခြင်း —— ထိန်းသိမ်းမှုအတွက် high concentration primers များကိုအသေးငယ်ဆုံးဖြစ်အောင်စုဆောင်းပါ။ အအေးခဲခြင်း၊ အရည်ပျော်ခြင်း (သို့) ၄ ဒီဂရီစင်တီဂရိတ်ရေရှည်သိုလှောင်ခြင်းကိုရှောင်ကြဉ်ပါ။
ers primer များ၏မမှန်ကန်သောဒီဇိုင်း (ဥပမာ primer အရှည်မလုံလောက်ခြင်း၊ primer များအကြား dimer ဖွဲ့ခြင်း၊ )
A-3 Mg၂+အာရုံစူးစိုက်မှု
မောင်မောင်၂+ အာရုံစူးစိုက်မှုအလွန်နည်းသည် - Mg ကိုမှန်ကန်စွာတိုးမြှင့်ပါ၂+ အာရုံစူးစိုက်မှု: Mg ကိုပိုကောင်းအောင်လုပ်ပါ၂+ အကောင်းဆုံး Mg ကိုဆုံးဖြတ်ရန် ၁ မီလီမီတာမှ ၃ မီတာအထိတုံ့ပြန်မှုများဆက်တိုက်ပြုလုပ်ပြီးအာရုံစူးစိုက်မှုကိုအာရုံစူးစိုက်မှု၂+ ပုံစံတစ်ခုနှင့် primer တစ်ခုစီအတွက်အာရုံစူးစိုက်မှု
A-4 Annealing အပူချိန်
an မြင့်မားသောမီးခံအပူချိန်သည် primer နှင့် template ၏စည်းနှောင်အားကိုသက်ရောက်မှုရှိသည်။ —— မီးလောင်ကျွမ်းထားသောအပူချိန်ကိုလျှော့ချပြီး ၂ ဒီဂရီဆဲလ်စီးယပ်စ်ဖြင့်အခြေအနေကိုပိုကောင်းအောင်လုပ်ပါ။
A-5 Extension အချိန်
extension တိုတောင်းသောတိုးချဲ့အချိန် —— တိုးချဲ့မှုအချိန်ကိုတိုးပါ။
Phenomena: အနုတ်လက္ခဏာနမူနာများသည်ပစ်မှတ်အစဉ်လိုက်တီးဝိုင်းများကိုလည်းပြသည်။
PCR ၏ A-1 ညစ်ညမ်းမှု
target ပစ်မှတ်ဆင့်ပွားခြင်း (သို့) ချဲ့ထွင်ထားသောထုတ်ကုန်များ၏ညစ်ညမ်းမှုကိုဖြတ်ပါ၊ အနုတ်လက္ခဏာနမူနာတွင် ဦး တည်ချက်ပါ ၀ င်သောနမူနာကိုပိုက်ဖြင့်မပစ်ပါနှင့်၊ centrifuge ပြွန်မှယိုစေပါ။ ဓာတ်ကူပစ္စည်းများသို့မဟုတ်ကိရိယာများသည်ရှိပြီးသား nucleic အက်ဆစ်များကိုဖယ်ရှားရန် autoclaved ဖြစ်သင့်ပြီးညစ်ညမ်းမှုတည်ရှိမှုကိုအနုတ်လက္ခဏာထိန်းချုပ်မှုစမ်းသပ်မှုများဖြင့်ဆုံးဖြတ်သင့်သည်။
■ Reagent ညစ်ညမ်းမှု - ဓာတ်ကူပစ္စည်းများကိုစုဆောင်းပြီးအပူချိန်နိမ့်သောနေရာတွင်ထားပါ။
A-2 Primer
မောင်မောင်၂+ အာရုံစူးစိုက်မှုအလွန်နည်းသည် - Mg ကိုမှန်ကန်စွာတိုးမြှင့်ပါ၂+ အာရုံစူးစိုက်မှု: Mg ကိုပိုကောင်းအောင်လုပ်ပါ၂+ အကောင်းဆုံး Mg ကိုဆုံးဖြတ်ရန် ၁ မီလီမီတာမှ ၃ မီတာအထိတုံ့ပြန်မှုများဆက်တိုက်ပြုလုပ်ပြီးအာရုံစူးစိုက်မှုကိုအာရုံစူးစိုက်မှု၂+ ပုံစံတစ်ခုနှင့် primer တစ်ခုစီအတွက်အာရုံစူးစိုက်မှု
ro မမှန်ကန်သော primer ဒီဇိုင်း၊ ပစ်မှတ်အစီအစဉ်သည်ပန်းတိုင်မဟုတ်သောအစီအစဉ်နှင့်တူညီသည်။ --- ပြန်လည်ဒီဇိုင်းဒီဇိုင်းများ
ဖြစ်ရပ်များ: PCR အသံချဲ့စက်များသည်မျှော်မှန်းထားသောအရွယ်အစားနှင့်ကြီးကြီးမားမား၊ သေးငယ်သည်ဖြစ်စေ၊ တစ်ခါတစ်ရံတွင်သီးခြားအသံချဲ့ခွင်များနှင့်မတိကျသောအသံချဲ့ခွင်များဖြစ်ပေါ်သည်။
A-1 Primer ဖြစ်သည်
prim primer တိကျမှုအားနည်းသည်
--- ပြန်လည်ဒီဇိုင်း primer
prim primer အာရုံစူးစိုက်မှုအလွန်မြင့်မားသည် - denaturation temperature ကိုမှန်မှန်ကန်ကန်မြင့်တက်စေပြီး denaturation ကြာရှည်စေသည်။
A-2 Mg၂+ အာရုံစူးစိုက်မှု
မောင်၂+ အာရုံစူးစိုက်မှုမြင့်လွန်းသည် - Mg2+ အာရုံစူးစိုက်မှုကိုမှန်ကန်စွာလျှော့ချပါ၊ Mg ကိုပိုကောင်းအောင်လုပ်ပါ၂+ အကောင်းဆုံး Mg ကိုဆုံးဖြတ်ရန် ၁ မီလီမီတာမှ ၃ မီတာအထိတုံ့ပြန်မှုများဆက်တိုက်ပြုလုပ်ပြီးအာရုံစူးစိုက်မှုကိုအာရုံစူးစိုက်မှု၂+ ပုံစံတစ်ခုနှင့် primer တစ်ခုစီအတွက်အာရုံစူးစိုက်မှု
A-3 အပူထိန်းနိုင်သော polymerase
enzy အလွန်အကျွံအင်ဇိုင်းပမာဏ — 0.5 ၀.၅ ယူနစ်ကြားတွင်သင့်တော်သောအင်ဇိုင်းပမာဏကိုသင့်တော်စွာလျှော့ချပါ။
A-4 Annealing အပူချိန်
ne မီးခံအပူချိန်သည်နိမ့်လွန်းသည်-သင့်လျော်သော annealing အပူချိန်ကိုသင့်လျော်စွာတိုးမြှင့်ခြင်း (သို့) အဆင့်နှစ်ဆင့်ခွဲခြင်းနည်းလမ်းကိုသုံးပါ။
A-5 PCR ဟုတ်ရဲ့လား
PC PCR သံသရာများလွန်းခြင်း - PCR စက်ဝန်းအရေအတွက်ကိုလျှော့ချပါ။
A-1 Primer ဖြစ်သည်—- ပိုဆိုးသောထူးခြားမှု —— primer ကိုပြန်လည်ဒီဇိုင်းဆွဲပါ၊ primer ၏အနေအထားနှင့်အရှည်ကိုပြောင်းပါ။ သို့မဟုတ် nested PCR လုပ်ဆောင်ပါ။
A-2 Template သည် DNA ဖြစ်သည်
—— ပုံစံခွက်သည်မသန့်ရှင်းပါ —— ပုံစံခွက်ကိုသန့်စင်ပါ၊ သို့မဟုတ်သန့်ရှင်းသောဆေးသေတ္တာများဖြင့် DNA ကိုထုတ်ယူပါ။
A-3 Mg၂+ အာရုံစူးစိုက်မှု
--- မောင်၂+ အာရုံစူးစိုက်မှုအလွန်မြင့်မားသည် - Mg ကိုမှန်ကန်စွာလျှော့ချပါ၂+ အာရုံစူးစိုက်မှု: Mg ကိုပိုကောင်းအောင်လုပ်ပါ၂+ အကောင်းဆုံး Mg ကိုဆုံးဖြတ်ရန် ၁ မီလီမီတာမှ ၃ မီတာအထိတုံ့ပြန်မှုများဆက်တိုက်ပြုလုပ်ပြီးအာရုံစူးစိုက်မှုကိုအာရုံစူးစိုက်မှု၂+ ပုံစံတစ်ခုနှင့် primer တစ်ခုစီအတွက်အာရုံစူးစိုက်မှု
A-4 dNTP
—— dNTP ၏အာရုံစူးစိုက်မှုမြင့်လွန်းသည် —— dNTP ၏အာရုံစူးစိုက်မှုကိုသင့်လျော်စွာလျှော့ချပါ
A-5 Annealing အပူချိန်
—— အလွန်နည်းသော annealing အပူချိန် —— သင့်လျော်သော annealing အပူချိန်ကိုသင့်လျော်စွာတိုးမြှင့်ပါ
A-6 Cycles
—— သံသရာအလွန်များ —— စက်ဝန်းနံပါတ်ကိုပိုကောင်းအောင်လုပ်ပါ
ပထမအဆင့်သည်သင့်တော်သော polymerase ကိုရွေးချယ်ရန်ဖြစ်သည်။ ပုံမှန် Taq polymerase သည် 3'-5 'exonuclease လုပ်ဆောင်ချက်မရှိခြင်းကြောင့်စာပြန်စစ်။ မရပါကမကိုက်ညီလျှင်အပိုင်းအစများ၏တိုးချဲ့မှုထိရောက်မှုကိုများစွာလျော့ကျစေသည်။ ထို့ကြောင့်ပုံမှန် Taq polymerase သည် 5 kb ထက်ကြီးသောပစ်မှတ်အပိုင်းအစများကိုထိထိရောက်ရောက်မချဲ့နိုင်ပါ။ Taq polymerase ကိုအထူးပြုပြင်မွမ်းမံခြင်းသို့မဟုတ်အခြားမြင့်မားသောသစ္စာရှိမှု polymerase တို့ဖြင့် extension efficiency ကိုမြှင့်တင်ရန်နှင့်ရှည်လျားသောအပိုင်းအစချဲ့ထွင်မှုလိုအပ်ချက်များကိုဖြည့်ဆည်းရန်ရွေးချယ်သင့်သည်။ ထို့အပြင်အပိုင်းအစရှည်များချဲ့ခြင်းသည် primer ဒီဇိုင်း၊ denaturation time၊ extension time၊ buffer pH စသည်ဖြင့်လိုက်လျောညီထွေဖြစ်အောင်ညှိရန်လိုအပ်သည်။ အများအားဖြင့် 18-24 bp ပါသော primers များသည်အထွက်နှုန်းပိုကောင်းစေနိုင်သည်။ ပုံစံခွက်ပျက်စီးမှုကိုကာကွယ်ရန် ၉၄ ဒီဂရီစင်တီဂရိတ်တွင် denaturation time ကိုတစ်စက္ကန့် ၃၀ သို့လျှော့ချရန်နှင့်အသံချဲ့စက်မတိုင်မီအပူချိန် ၉၄ ဒီဂရီစင်တီဂရိတ်သို့ ၁ မိနစ်ထက်နည်းသင့်သည်။ ၎င်းအပြင်တိုးချဲ့အပူချိန်ကို ၆၈ ဒီဂရီစင်တီဂရိတ်ခန့်တွင်သတ်မှတ်ပေးပြီးတိုးချဲ့ချိန်ကို ၁ kb/min နှုန်းအတိုင်းဒီဇိုင်းဆွဲခြင်းဖြင့်ရှည်လျားသောအပိုင်းအစများကိုထိရောက်စွာချဲ့ထွင်နိုင်သည်။
PCR အသံချဲ့စက်၏အမှားနှုန်းကိုမြင့်မားသောတည်ကြည်မှုနှင့်အတူအမျိုးမျိုးသော DNA polymerases များကို သုံး၍ လျှော့ချနိုင်သည်။ ယခုအချိန်ထိ Taq DNA polymerases များအားလုံးတွင် Pfu အင်ဇိုင်းသည်အနိမ့်ဆုံးအမှားနှုန်းနှင့်အမြင့်ဆုံးသစ္စာရှိမှု (ပူးတွဲဇယားတွင်ကြည့်ပါ) ။ အင်ဇိုင်းရွေးချယ်မှုအပြင်သုတေသီများသည်ကြားခံဖွဲ့စည်းမှုကိုတိုးတက်စေခြင်း၊ အပူထိန်းနိုင်သော polymerase ၏အာရုံစူးစိုက်မှုနှင့် PCR စက်ဝန်းအရေအတွက်ပိုမိုကောင်းမွန်စေခြင်းအပါအ ၀ င်တုံ့ပြန်မှုအခြေအနေများကိုပိုမိုကောင်းမွန်စေခြင်းဖြင့်ပိုမိုလျှော့ချနိုင်သည်။
စတင်တည်ထောင်ကတည်းကကျွန်ုပ်တို့၏စက်ရုံသည်နိယာမကိုလိုက်နာခြင်းဖြင့်ပထမကမ္ဘာအဆင့်ထုတ်ကုန်များကိုတီထွင်ခဲ့သည်
အရည်အသွေးပထမ ကျွန်ုပ်တို့၏ထုတ်ကုန်များသည်စက်မှုလုပ်ငန်းတွင်အလွန်နာမည်ကောင်းရခဲ့ပြီးဖောက်သည်အသစ်နှင့်အဟောင်းများကြားတွင်အဖိုးတန်လက်ဖွဲ့ပစ္စည်းများဖြစ်သည်။